Główne skandale związane z Antonim Macierewiczem to:

- Afera z likwidacją Wojskowych Służb Informacyjnych (WSI) w latach 2000–2006, gdzie zarzucono mu nadużycia.

- Krytyka wydatków na modernizację armii podczas jego kadencji, oskarżane o nieefektywność.

- Konflikt z prezydentem Andrzejem Dudą w 2017 roku, który doprowadził do jego odwołania z ministerstwa.

Te wydarzenia często kończyły się postępowaniami sądowymi lub komisjami sejmowymi.